Натуральные пептиды, поступающие с пищей или вырабатываемые организмом, абсолютно безопасны. Синтетические аналоги также редко вызывают побочные эффекты, так как имеют схожую с естественными структуру. Однако их бесконтрольный приём, особенно в высоких дозах, может нарушить внутренний баланс. Например, избыток ростовых пептидов способен спровоцировать гипертрофию органов. Аллергические реакции встречаются, но преимущественно на вспомогательные компоненты препаратов. Ключевое правило — соблюдение дозировок и врачебный контроль.